Nuevo invento desvela el misterio del plegamiento de las proteínas

Científicos del Oak Ridge National Laboratory han desarrollado un programa que permite hacer una rápida predicción de la estructura tridimensional de la proteína.

Este es el primer estudio en el que un equipo científico es capaz de predecir por ordenador la estructura tridimensional de una proteína, de una manera independiente de su tamaño. Además de predecir la estructura tridimensional, también es capaz de predecir los estados intermedios de plegamiento, hecho que tiene importancia para el diseño de fármacos contra enfermedades caracterizadas por la presencia de proteínas mal plegadas.

El inventor Pratul Agarwal, miembro del departamento de ciencias informáticas y matemáticas del ORNL, afirma que este descubrimiento puede tener muchas aplicaciones industriales en la ingeniería de proteínas, para poder diseñar enzimas más eficientes. Mediante este enfoque, se sigue la dinámica natural intrínseca de la proteína, al promover los modos dinámicos relevantes, permitiendo así una rápida exploración de la vía de plegamiento proteico y así predecir la estructura proteica.

El inventor de este software, rápidamente procedió a patentar el invento bajo el título: “Métodos computacionales rápidos para descifrar el mecanismo de plegamiento proteico y predecir la estructura de una proteína a partir de la secuencia primaria”. Link a la patente aquí.

Fuente original de la noticia: DOE/Oak Ridge National Laboratory. “New invention unravels mystery of protein folding. “ScienceDaily”. 14 Sep.2011. Link a la noticia

Artículos en los que se basa la noticia:

• Arvin Ramanthan, Andrej J. Savol, Christopher J. Lamgmead, Pratul K. Agarwal, Chakra S. Chennubhotla. Discovering Conformational Sub-States Relevant to Protein Function. PLoS ONE, 2011; 6(1):e15827 DOI.

• Jose M. Borreguero, Junhong He, F. Meilleur, Kevin L. Weiss, Craig M. Brown, Dean A. Myles Kenneth W. Herwig, Pratul K. Agarwal. Redox-Promoting protein Motions in Rubredoxin. The Journal of Physical Chemistry B, 2011; 115(28): 8925 DOI.

Noticia adaptada de mi blog personal Noticias de ciencias: Link a la noticia

Autor: Juan Fandiño Gómez

Troncales dentales para la regeneración ósea.

Un equipo japones de la Universidad de Nagoya ha demostrado, a través de un estudio con perros, que las células madre dentales son una fuente para la regeneración ósea entre progenitores y cachorros.

¿Cómo han llegado a esta conclusión? A través de un estudio que ha consistido en lo siguiente: se han extraído células madre de dientes de leche y de la pulpa dental de caninos y se han visto que estas células pueden diferenciarse en otros tipos celulares (osteoblastos, odontoblastos,...). Tras esta observación, han extraído estas celulas de dientes de cachorros y las han injertardo en la mandíbula dañada de sus progenitores. Una vez hecho esto, se les ha realizado un seguimiento durante 8 semanas para ver su evolución.

Transcurrido ese tiempo, se observó la formacion de un nuevo hueso neovascularizado, por lo que se ha llegado a la conclusión de que estas celulas madre dentales inciden en la actividad inmunosupresora.

Fuente: http://noticias.ont.es/ficheros/53135638.pdf
Sara Durán Cerviño

Biotecnologia en Girasol y Soja

     En la  ultima  década ha habido un  mejoramiento  en la  siembra , producción  y  rendimiento  en el  cultivo  del  Girasol y la Soja  gracias  al  mejor  uso  de  marcadores  moleculares  y  de  trangénicos en el caso de la Soja.
     Hoy  en  día  el  conocimiento  respecto  al  genoma  del  Girasol  es limitado, sin embargo , hay  proyectos  nacionales  y  internacionales , como el  del  Instituto de Biotecnologia del INTA Castelar  que  presenta  sus  herramientas  moleculares  como son  los  microsatélites  y  otros  marcadores  asociados  a  caracteres funcionales, regulatorios o metábolicos. La  ventaja  de  estos  marcadores  son la practicidad , bajo coste , alta  reproducibilidad  y  capacidad  para  detectar  diferencias  entre  individuos  muy  relacionados  geneticamente.
     Para  la  identificación  de  marcadores específicos  se  desarrollo una  colección  de  secuencias  genéticas clonadas  de  girasol a partir  de  distintos tejidos  y  estados  fisiológicos, estas  secuencias son  copia  de los  transcriptos  de los  tejidos,  esto ha  permitido  la secuenciación  completa  del genoma  de Arabidopsis thaliana. A  partir  de  aqui  se  pueden  realizar  analisis  comparativos  de  funcionalidad  que  permite  la  identificación  de  genes  importantes para la  agronomía, con  la  aplicación  de  Técnicas de  Hibridación ``in situ´´ con sondas  fluorecentes de ADN específico(FISH) y/o ADN genómico(GISH).
     Hoy  en  día  no  existe  el Girasol  transgénico  pero  se  sigue  investigando  en ello  ya que  podría  ser  un  gran  impacto  como lo  fue  la Soja  transgénica, ya que, gracias  a  los  marcadores  moleculares  en la  soja  se  ha  encontrado  una variante  de una  gen  que  confiere  resistencia  a  una  enfermedad  importante en el cultivo de la Soja, La  Podredumbre Húmeda de Raíz y Tallo,  producida por un hongo Phytophtora sojae. También  se  aplican  marcadores  moleculares para  obtener  un  desarrollo  mas  eficiente  de  nuevas  variedades.
     Y ya para concluir, comentar  que  estas  técnicas  se  estan  usando  fundamentalmente  para  acumular  genes  resistentes  a  enfermedades  importantes ( como la  Podredumbre de Raíz y Hoja, la Mancha Ojo de Rana y  el  Nematodo del  quiste  de la Soja)  que  afectan  al  rendimiento  del cultivo.

Mario Adrian De Sousa Benitez

Fuentes: www.procisur.org.uy/online/docs/soja_girasol.doc  y  www.inta.gov.ar/ediciones/idia/oleaginosa/sojaygira01.pdf

El transplante de células madre nerviosas puede abordar la diabetes

Un grupo de investigadores japoneses del Instituto de AIST en Tsukuba, ha demostrado que las propias células madre nerviosas de pacientes diabéticos se pueden usar como alternativa a las células beta pancreáticas para tratar la diabetes.

La diabetes es una enfermedad causada por un único tipo celular que provoca la ausencia de producción de insulina pancreática. En este estudio se realizó un tratamiento de reemplazo de células. Para ello, lo que hicieron fue coger células del hipocampo y del bulbo olfactivo, que son tejidos de fácil accesibilidad, e inyertarlas en el páncreas.

Como consecuencia observaron que las células madre además de expresar las características de las células beta también aumentaron la producción de insulina y redujeron los niveles de glucosa en sangre, sin necesidad de manipulación genética, por lo que son una buena solución para apaliar la diabetes.

Fuente:

http://onlinelibrary.wiley.com/journal/10.1002/(ISSN)1757-4684/homepage/pr_20.htm

Artículo original: Kuwabara, T (2011) Neural stem cell transplant may tackle diabetes. EMBO Molecular Medicine (online)

DOI:10.1002/emmm.201100177

Sara Durán Cerviño