Científicos del Oak Ridge National Laboratory han desarrollado un programa que permite hacer una rápida predicción de la estructura tridimensional de la proteína.
Este es el primer estudio en el que un equipo científico es capaz de predecir por ordenador la estructura tridimensional de una proteína, de una manera independiente de su tamaño. Además de predecir la estructura tridimensional, también es capaz de predecir los estados intermedios de plegamiento, hecho que tiene importancia para el diseño de fármacos contra enfermedades caracterizadas por la presencia de proteínas mal plegadas.
El inventor Pratul Agarwal, miembro del departamento de ciencias informáticas y matemáticas del ORNL, afirma que este descubrimiento puede tener muchas aplicaciones industriales en la ingeniería de proteínas, para poder diseñar enzimas más eficientes. Mediante este enfoque, se sigue la dinámica natural intrínseca de la proteína, al promover los modos dinámicos relevantes, permitiendo así una rápida exploración de la vía de plegamiento proteico y así predecir la estructura proteica.
El inventor de este software, rápidamente procedió a patentar el invento bajo el título: “Métodos computacionales rápidos para descifrar el mecanismo de plegamiento proteico y predecir la estructura de una proteína a partir de la secuencia primaria”. Link a la patente aquí.
Fuente original de la noticia: DOE/Oak Ridge National Laboratory. “New invention unravels mystery of protein folding. “ScienceDaily”. 14 Sep.2011. Link a la noticia
Artículos en los que se basa la noticia:
- Arvin Ramanthan, Andrej J. Savol, Christopher J. Lamgmead, Pratul K. Agarwal, Chakra S. Chennubhotla. Discovering Conformational Sub-States Relevant to Protein Function. PLoS ONE, 2011; 6(1):e15827 DOI.
Jose M. Borreguero, Junhong He, F. Meilleur, Kevin L. Weiss, Craig M. Brown, Dean A. Myles Kenneth W. Herwig, Pratul K. Agarwal. Redox-Promoting protein Motions in Rubredoxin. The Journal of Physical Chemistry B, 2011; 115(28): 8925 DOI.
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